Protein–RNA interactions for Protein: O94941

UBOX5, RING finger protein 37, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBOX5O94941 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBOX5O94941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBOX5O94941 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBOX5O94941 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms