Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP1O94782 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP1O94782 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP1O94782 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP1O94782 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP1O94782 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP1O94782 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP1O94782 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP1O94782 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP1O94782 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP1O94782 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP1O94782 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP1O94782 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP1O94782 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP1O94782 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP1O94782 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP1O94782 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP1O94782 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP1O94782 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP1O94782 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP1O94782 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP1O94782 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP1O94782 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP1O94782 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
USP1O94782 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP1O94782 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP1O94782 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP1O94782 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP1O94782 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP1O94782 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP1O94782 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP1O94782 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP1O94782 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP1O94782 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP1O94782 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP1O94782 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP1O94782 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP1O94782 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP1O94782 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP1O94782 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms