Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLOT1O75955 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLOT1O75955 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLOT1O75955 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms