Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VAMP4O75379 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
VAMP4O75379 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VAMP4O75379 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VAMP4O75379 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms