Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYNGR3O43761 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR3O43761 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR3O43761 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms