Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BUD23O43709 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BUD23O43709 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BUD23O43709 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BUD23O43709 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BUD23O43709 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BUD23O43709 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BUD23O43709 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BUD23O43709 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BUD23O43709 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BUD23O43709 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BUD23O43709 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BUD23O43709 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BUD23O43709 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BUD23O43709 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BUD23O43709 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BUD23O43709 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BUD23O43709 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BUD23O43709 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BUD23O43709 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BUD23O43709 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BUD23O43709 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BUD23O43709 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BUD23O43709 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BUD23O43709 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BUD23O43709 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BUD23O43709 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BUD23O43709 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BUD23O43709 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BUD23O43709 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BUD23O43709 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms