Protein–RNA interactions for Protein: O43491

EPB41L2, Band 4.1-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L2O43491 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPB41L2O43491 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EPB41L2O43491 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L2O43491 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L2O43491 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EPB41L2O43491 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms