Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF3O43395 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF3O43395 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF3O43395 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms