Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOXA2O43364 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOXA2O43364 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms