Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPAA1O43292 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPAA1O43292 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPAA1O43292 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPAA1O43292 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPAA1O43292 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
GPAA1O43292 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPAA1O43292 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPAA1O43292 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPAA1O43292 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPAA1O43292 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms