Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.672e-15■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 EPS8L2-221ENST00000531471 448 ntTSL 321.17■□□□□ 0.988e-26■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 AES-204ENST00000585782 505 ntTSL 213.95□□□□□ -0.181e-33■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.071e-11■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.051e-11■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.951e-11■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 226.98■■□□□ 1.911e-11■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.771e-11■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 EEF1AKMT2-202ENST00000464099 1013 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 EEF1AKMT2-203ENST00000466270 3587 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 ATXN7L3-204ENST00000587022 298 ntTSL 39.1□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.54□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 414.39□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 220.9■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 AHCY-206ENST00000606061 1170 ntTSL 218.88■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 AHCY-203ENST00000473516 488 ntTSL 312.08□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 30.3
PRPF4O43172 PI4KA-215ENST00000485963 2301 ntTSL 224.76■■□□□ 1.554e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 416.77■□□□□ 0.284e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 30.2
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PRPF4O43172 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 30.2
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PRPF4O43172 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)20.09■□□□□ 0.818e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.28e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.088e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 214.95□□□□□ -0.028e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-211ENST00000566601 2536 ntTSL 29.84□□□□□ -0.838e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 GLG1-207ENST00000563432 555 ntTSL 36.83□□□□□ -1.328e-9■■■■■ 30.2
PRPF4O43172 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 522.51■■□□□ 1.193e-8■■■■■ 30.2
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PRPF4O43172 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.25e-8■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 ODF3B-208ENST00000468249 1722 ntTSL 1 (best)25.49■■□□□ 1.671e-9■■■■■ 30.1
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PRPF4O43172 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 XRCC3-217ENST00000556980 801 ntTSL 517.12■□□□□ 0.335e-9■■■■■ 30.1
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PRPF4O43172 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.125e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-9■■■■■ 30.1
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PRPF4O43172 PASK-214ENST00000493544 5174 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.165e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-220ENST00000566409 395 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.225e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 XRCC3-206ENST00000554170 572 ntTSL 412.21□□□□□ -0.455e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.475e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 PASK-215ENST00000544142 4724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 311.31□□□□□ -0.65e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.635e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 FANCA-225ENST00000567621 618 ntTSL 39.44□□□□□ -0.95e-9■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HJURP-203ENST00000414924 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 419.32■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HJURP-208ENST00000453122 634 ntTSL 416.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 30.1
PRPF4O43172 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 30.1
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