Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD51BO15315 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD51BO15315 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD51BO15315 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD51BO15315 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms