Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIPC1O14908 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GIPC1O14908 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIPC1O14908 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.5 ms