Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF5O14894 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF5O14894 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF5O14894 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms