Protein–RNA interactions for Protein: O14617

AP3D1, AP-3 complex subunit delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3D1O14617 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3D1O14617 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3D1O14617 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3D1O14617 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3D1O14617 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3D1O14617 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3D1O14617 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3D1O14617 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms