Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSPB6O14558 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HSPB6O14558 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HSPB6O14558 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms