Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SOCS3O14543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SOCS3O14543 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SOCS3O14543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 965.8 ms