Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLL1O00548 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLL1O00548 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DLL1O00548 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DLL1O00548 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DLL1O00548 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DLL1O00548 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DLL1O00548 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DLL1O00548 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DLL1O00548 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DLL1O00548 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DLL1O00548 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL1O00548 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL1O00548 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL1O00548 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DLL1O00548 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DLL1O00548 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DLL1O00548 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DLL1O00548 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DLL1O00548 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DLL1O00548 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DLL1O00548 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DLL1O00548 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DLL1O00548 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DLL1O00548 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DLL1O00548 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DLL1O00548 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DLL1O00548 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL1O00548 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL1O00548 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL1O00548 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL1O00548 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DLL1O00548 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DLL1O00548 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DLL1O00548 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL1O00548 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL1O00548 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL1O00548 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL1O00548 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DLL1O00548 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DLL1O00548 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DLL1O00548 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL1O00548 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL1O00548 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL1O00548 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DLL1O00548 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL1O00548 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL1O00548 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL1O00548 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL1O00548 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DLL1O00548 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL1O00548 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL1O00548 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL1O00548 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DLL1O00548 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL1O00548 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL1O00548 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL1O00548 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DLL1O00548 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms