Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE2AO00408 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE2AO00408 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE2AO00408 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE2AO00408 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms