Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UPK1AO00322 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPK1AO00322 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UPK1AO00322 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UPK1AO00322 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms