Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STX16-NPEPL1H3BU86 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX16-NPEPL1H3BU86 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STX16-NPEPL1H3BU86 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX16-NPEPL1H3BU86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms