Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMO7DNF2Z398 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO7DNF2Z398 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms