Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIF28PB7ZC32 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIF28PB7ZC32 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIF28PB7ZC32 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms