Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
B4DEV8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
B4DEV8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
B4DEV8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
B4DEV8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
B4DEV8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
B4DEV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
B4DEV8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
B4DEV8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B4DEV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
B4DEV8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B4DEV8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B4DEV8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
B4DEV8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
B4DEV8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
B4DEV8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
B4DEV8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DEV8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DEV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DEV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DEV8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
B4DEV8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DEV8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DEV8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DEV8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
B4DEV8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
B4DEV8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
B4DEV8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DEV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DEV8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DEV8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DEV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
B4DEV8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
B4DEV8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
B4DEV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms