Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM114B3SHH9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM114B3SHH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM114B3SHH9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms