Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00587B1AMM8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00587B1AMM8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00587B1AMM8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00587B1AMM8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms