Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ISM1B1AKI9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM1B1AKI9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM1B1AKI9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms