Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCE1LA8MT33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCE1LA8MT33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms