Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PP2D1A8MPX8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PP2D1A8MPX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PP2D1A8MPX8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PP2D1A8MPX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms