Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC169A6NNP5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC169A6NNP5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC169A6NNP5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms