Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DBX1A6NMT0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DBX1A6NMT0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DBX1A6NMT0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms