Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RGPD3A6NKT7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RGPD3A6NKT7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RGPD3A6NKT7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD3A6NKT7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms