Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LIPT2A6NK58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIPT2A6NK58 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms