Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN8A6NHC0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN8A6NHC0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN8A6NHC0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN8A6NHC0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms