Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMCO2A6NFE2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMCO2A6NFE2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMCO2A6NFE2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMCO2A6NFE2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms