Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6BA6NDN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6BA6NDN3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6BA6NDN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms