Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC35F4A4IF30 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC35F4A4IF30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC35F4A4IF30 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms