Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPED1A4D0V7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPED1A4D0V7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPED1A4D0V7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms