Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMB4A4D0S4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMB4A4D0S4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMB4A4D0S4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMB4A4D0S4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMB4A4D0S4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LAMB4A4D0S4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LAMB4A4D0S4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMB4A4D0S4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms