Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC78A2IDD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC78A2IDD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC78A2IDD5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms