Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM223A0PJW6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms