Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA6A0AVT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA6A0AVT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA6A0AVT1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms