Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087X1B8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087X1B8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087X1B8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087X1B8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms