Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX9Q9Y5X1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms