Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN4Q9NRR5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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