Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CELF4Q9BZC1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CELF4Q9BZC1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms