Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms