Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms