Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SGIP1Q9BQI5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms