Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQB6

VKORC1, Vitamin K epoxide reductase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VKORC1Q9BQB6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VKORC1Q9BQB6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VKORC1Q9BQB6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms